生理性因素主要和年龄增长有关，这是正常的生理变化，就像皮肤会随着年龄增长出现皱纹一样。随着年龄增长，人体各项机能会自然衰退，牙龈部位的胶原蛋白会慢慢流失，牙龈组织会逐渐变薄、退缩，导致牙根轻微外露。这种生理性萎缩通常进展缓慢，程度也比较轻微，一般不会伴随明显的不适，也不会对牙齿健康造成太大影响，做好日常口腔护理即可。
病理性因素是导致牙龈萎缩的主要原因，其中常见的就是牙周疾病。长期不注意口腔卫生，食物残渣、软垢会在牙齿表面形成牙菌斑，若不及时清理，会逐渐钙化形成牙结石。牙菌斑和牙结石会持续刺激牙龈，引发牙龈炎，若炎症长期不治疗，会进一步发展为牙周炎，破坏牙龈和牙槽骨，导致牙龈退缩、牙根外露，还可能伴随牙龈红肿、刷牙出血、口臭等症状。
不良的口腔习惯也会诱发牙龈萎缩。比如刷牙方式不正确，用力过猛、横着刷牙，会长期刺激牙龈，损伤牙龈组织，慢慢导致牙龈退缩；长期用一侧咀嚼，会使另一侧牙龈缺乏刺激，血流循环不畅，也可能出现萎缩；此外，长期咬硬物、佩戴不合适的假牙或正畸牙套，会对牙龈造成持续压迫和刺激，引发萎缩。
还有一些其他因素也可能导致牙龈萎缩，比如牙齿不齐、拥挤，会导致清洁困难，局部牙菌斑和牙结石堆积，刺激牙龈；长期吸烟、酗酒，会影响牙龈的血流循环和新陈代谢，降低牙龈的抵抗力，加速牙龈萎缩；部分全身性疾病，也可能间接影响牙龈健康，导致萎缩。
