牙齿矫正目前已经是比较常见的口腔治疗方式，大多数人在规范治疗和正确护理的情况下，通常不会出现明显后遗症。
比较常见的是牙齿酸胀和轻微疼痛。尤其是在刚戴牙套或复诊加力后的几天内，牙齿受到移动力量影响，可能会出现咬东西酸软、不舒服的感觉，一般会随着适应逐渐减轻。
还有一部分人担心牙齿会不会变松。实际上，牙齿在矫正过程中会发生正常移动，因此短时间内可能有轻微松动感，但只要牙周健康、矫正方案合理，大多数人在治疗结束后会逐渐稳定。如果本身牙周条件较差，或者存在牙龈萎缩、牙槽骨吸收等问题，就可能增加牙齿松动风险，因此矫正前通常需要先做牙周检查。
另外，如果矫正期间口腔清洁不到位，也容易出现牙龈红肿、牙结石增多、蛀牙甚至牙釉质脱矿的问题。有些人摘掉牙套后，牙面会出现白斑，其实多数和刷牙不认真、长期清洁不足有关，而不完全是牙套本身造成的。
还有一种比较多人关注的问题，就是“反弹”。如果矫正结束后不按要求佩戴保持器，牙齿确实有可能慢慢移位，所以保持阶段非常重要。有些人觉得摘掉牙套就结束了，结果没坚持戴保持器，后期牙齿又变乱。
